舞台はグラン・ロロ＝レクリスを飛び出し神世界。
「契約調停機関」の謎を追い、ダンは「契約の創界神」を捜し求める。
最高意思決定機関「オリン十二神評議会」を擁する。
経緯は不明だが創界神アレスと創界神ディオニュソスが十二神に復帰している。
ハデス、ゼウス、ヘラ、ポセイドン、デメテールは第2世代にあたり、それ以外の既存の面々は第3世代以降にあたると思われる。
ゼウスに追放されていた第1世代のオリンの創界神たち。
ハデスに管理されていたとも噂されており、その復活の経緯には謎が多い。
契約調停機関と繋がっている。
謎の勢力。
原初神群の侵攻を受けているらしく、オリンと原初神群の戦いに参戦する。
ダン、カイ、トアの共闘によって最後の審判者フェイタル・ジャッジメントが退けられ、レクリスはグラン・ロロの記憶が顕在化した世界へ再構築された。
ひとまずの平和が戻るが、大きな謎が残された。グラン・ロロには存在しなかったはずの「契約調停機関」の存在である。
トアから「契約の創界神」が関わっていることを知らされたダンは契約の創界神を求め相棒たちと共に神世界ヘと旅立つ。
ダンが向かったのは知己の仲であるアポローンの世界「デルポ＝ナイラック」であった。
契約の創界神捜しにアポローンの協力を取り付けたダンだったが、突如として「オリン原初神群」の襲撃に巻き込まれる。
アポローンはダンと契約し対抗するが、契約が不完全だったためか撃退には至らず、敗北を悟ったアポローンはダンを逃がし重傷を負う。
神世界の漂流者となったダンは、ハデスに救出された。
ハデスはたちまちオリンを掌握すると、ダンに契約を持ちかける。
オリン内部でも様々な思惑が交錯する中、ダンと契約を締結したハデスは盟主就任とダンとの契約を神世界に向け発表した。
一方、キニチ・アハウは「創造主」の導きの元ダンを助けるためオリンに潜入していた……。
ハデスの発表に対するウラノスの声明と共に、ガイア率いる10万以上の原初神群の軍勢がオリンの最も外側に位置するヘルカディアに迫る。
ガイアと交戦を開始するヘルメスだが、ハデスは静観の構えを崩さない。
ヘルメスを助けに行きたいダンは動かないハデスに痺れを切らす。そんなダンにキニチ・アハウが声をかけ、空間を飛び越える能力を持つハデスの配下を探しに行くことになる。
その頃、ヘルカディアでは七大英雄獣率いるヘルメス配下の剣獣とガイア配下の爬獣の戦いが膠着状態に陥っていた。
そこに割って入ったのはウルリカのフラカン。
ガイアに攻撃を加えたフラカンはオリンの援軍になるかと思われたが、部外者の乱入が気に食わないヘルメスと一触即発になる。
そこへダンがアポローンの星竜、ランポ、シャックやその他オリン所属の賛同者を率いて現れた。
さらにはぐれていたスタークとフェニルも合流。
ヘルメス軍は勢いづき、さらに戦いを通してフラカンとも息を合わせていく。
苛立つガイアは大幻羅魔獣テュポーデウスを召喚。
しかしヘルメスとフラカンは臆せず同時攻撃を仕掛ける。
ヘルメスはガイアに、フラカンはバイクに変形した爆速嵐機獣チチェン・ゼッファーに跨りテュポーデウスにそれぞれ突撃。ついにガイアを退けることに成功する。
その戦いを傍で見ていたのは契約者カイ。
カイが原初神群に通じているのか問いかけるダンだったが、キニチ・アハウがカイはウルリカの契約者だと明かす。
ならばと共闘を持ちかけるダンに対し、カイは「対立しているわけではないが、いまさら仲間でもない」と自嘲する。
ひとまず原初神群の第2波を凌ぎ切ることには成功したのだった。
ガイア撃退後、アレスはダンと一時的に契約し、原初神群の前線基地攻めを行うが決定的なダメージを与えるには至らなかった。
その裏でハデスと密約を交わしたグラン・ロロの創界神がテスカトリポカとククルカンに原初神群の調査を依頼する。
テスカトリポカらがもたらした情報はハデスに伝わり、ハデスはヘラとヘファイストスを戦線に送り出す。
ウラノス率いる原初神群本隊の侵攻が始まり、ポセイドン、デメテール、アルテミス、ディオニュソスは各地で応戦。ダンに託されたアポローンの軍とアレスは遊撃隊となり、ヘルメスは伝令を担当。そしてヘラは前線を担当する。
一方ヘファイストスは独自に原初神群についたアプロディーテを追う。
テュポーデウスと星壊獣キマイステラーを前面に立て物量で押す原初神群に対し、ヘラの魔界軍団が対抗するが苦戦を強いられる。そこにウルリカ軍団が現れテュポーデウスを受け持つ。
さらにトアと契約したブリギット率いるケルティカ軍が参戦し、ダンと協力してキマイステラーに攻撃を仕掛ける。さらにグロウが合流し銀輪神機アリアンロッドとバイナレイター・ブレイズ・グロウがキマイステラーに止めを刺す。
ヘルメスにより伝えられた勝利の報はオリンを勢いづけるが、ウラノスはヘラに安い挑発を仕掛ける。まんまと乗ったヘラとの締皇対決に持ち込まれるが、ヘラは原初神群に包囲されている。
包囲網をダン、トア、ブリギットが打ち破るが……
