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カードがどんな分類に位置するかを示す。他のカードゲームで言うところの種族。 カード名の右または右上の系統欄に書かれ、その系統を参照したり対象とした効果を受ける。 種族を表し、基本的に一色をメインとして存在する系統（星竜、武装など）と、種族以外の分類を表す複数色にまたがって分布する系統（星魂、覇皇など）の二種類に分けられる。
長らく漢字表記のみが使われていたが、マスターを皮切りにカナ表記のものも登場するようになった。
バトルスピリッツでは系統を参照するカードが多数に渡るので、どのデッキでもある程度系統を統一して構築する事が多い。 複数の系統を持つカードも存在しており、現状では最大で3つの系統を持つものが存在する。
（複数の系統を持っているカードは各系統の解説ページで、カード名の後ろに()で別の系統を示しています。）
